Faktury zaliczkowe - moment odliczenia VAT
Wyjaśniamy, kiedy przedsiębiorca prowadzący JDG potrzebuje zaświadczenia A1, jak złożyć wniosek i uniknąć problemów podczas pracy za granicą.

Sebastian
Główny Księgowy

Dlaczego to temat, który ma realne znaczenie finansowe
Faktury zaliczkowe potrafią przesunąć VAT w czasie: u sprzedawcy podatek może stać się należny jeszcze przed dostawą lub wykonaniem usługi, a u nabywcy pojawia się pytanie o realny moment odliczenia.
To temat o cash-flow i o ryzyku ujęcia VAT w niewłaściwym okresie rozliczeniowym - zwłaszcza gdy zaliczki są częściowe, płacone w różnych terminach, a faktury wystawiane z opóźnieniem albo z wyprzedzeniem.
Dwa filary: sprzedawca (VAT należny) i nabywca (VAT naliczony)
Kluczowy błąd w praktyce polega na mieszaniu dwóch odrębnych perspektyw. Każda z nich rządzi się własną logiką.
Sprzedawca: kiedy powstaje obowiązek podatkowy przy zaliczce
Jeżeli przed dostawą towaru albo przed wykonaniem usługi sprzedawca otrzyma całość lub część zapłaty (m.in. zaliczkę, przedpłatę, zadatek), obowiązek podatkowy w VAT powstaje z chwilą otrzymania tej zapłaty - i wyłącznie w odniesieniu do kwoty faktycznie otrzymanej (art. 19a ust. 8 ustawy o VAT).
Przepis ten nie działa bezwarunkowo dla wszystkich czynności. Ustawa przewiduje wyłączenia m.in. dla czynności z katalogu art. 19a ust. 5 pkt 4: dostaw energii elektrycznej, cieplnej lub chłodniczej oraz gazu przewodowego, usług najmu, dzierżawy, leasingu, usług telekomunikacyjnych, ochrony mienia czy stałej obsługi prawnej i biurowej. Dla tych świadczeń obowiązek podatkowy rządzi się szczególnymi zasadami - wpłata zaliczki jest dla VAT neutralna.
Wniosek po stronie sprzedawcy: kluczowa jest data faktycznego otrzymania środków, a nie data wystawienia faktury.

Nabywca: kiedy powstaje prawo do odliczenia VAT od zaliczki
Po stronie nabywcy mechanizm jest sprzęgnięty z tym, co dzieje się u sprzedawcy.
Przy zaliczkach prawo do odliczenia powstaje w rozliczeniu za okres, w którym powstał obowiązek podatkowy u sprzedawcy - ale nie wcześniej niż w rozliczeniu za okres, w którym nabywca otrzymał fakturę (art. 86 ust. 10 w zw. z art. 86 ust. 10b pkt 1 oraz art. 86 ust. 10c ustawy o VAT). Kiedy odliczyć VAT z faktury KSeF?
Rozróżnienie jest w praktyce najistotniejsze: sprzedawca patrzy na datę otrzymania zapłaty (art. 19a ust. 8), a nabywca - na obowiązek podatkowy u sprzedawcy oraz na fakt posiadania faktury (art. 86 ust. 10 w zw. z art. 86 ust. 10b pkt 1 i art. 86 ust. 10c). Obie przesłanki muszą być spełnione łącznie.
Kluczowy warunek: zapłata jako sine qua non odliczenia - w reżimie zaliczkowym
W modelu objętym art. 19a ust. 8 obowiązek podatkowy po stronie sprzedawcy rodzi się wyłącznie z chwilą faktycznej zapłaty. Jeżeli zaliczka nie została zapłacona, ten mechanizm nie zostaje uruchomiony - nie powstaje “zaliczkowy” obowiązek podatkowy.
W konsekwencji nabywca nie ma merytorycznego punktu zaczepienia do odliczenia, nawet jeśli faktura jest już w jego posiadaniu. Ulga na złe długi w VAT i CIT
Faktura zaliczkowa sama w sobie nie tworzy prawa do odliczenia VAT - warunkiem koniecznym jest, by za dokumentem stała rzeczywista wpłata. Zasada ta dotyczy przypadków objętych reżimem art. 19a ust. 8; dla czynności podlegających szczególnym momentom obowiązku podatkowego (art. 19a ust. 5) logika jest odrębna.
Faktura zaliczkowa: kiedy musi być wystawiona, kiedy można jej nie wystawiać
Co powinna zawierać faktura zaliczkowa
Faktura zaliczkowa musi zawierać m.in.: dane podstawowe (zakres z art. 106e ust. 1 pkt 1-6), kwotę otrzymanej zapłaty, wyliczoną kwotę VAT obliczoną rachunkiem “w stu” oraz dane dotyczące zamówienia lub umowy pozwalające jednoznacznie powiązać wpłatę z konkretną przyszłą dostawą lub usługą (art. 106f ust. 1 ustawy o VAT). Ten wymóg identyfikacyjny ma znaczenie dowodowe - faktura zaliczkowa musi wskazywać, czego dotyczy transakcja. Weryfikacja faktur w biurze rachunkowym
Terminy wystawiania faktury zaliczkowej
Fakturę zaliczkową wystawia się do 15. dnia miesiąca następującego po miesiącu, w którym otrzymano zapłatę (art. 106i ust. 2 ustawy o VAT). Jednocześnie ustawa zabrania wystawiania faktury zbyt wcześnie: dokument nie może być wystawiony wcześniej niż 60 dni przed planowanym otrzymaniem zaliczki (art. 106i ust. 7 pkt 2 ustawy o VAT).
To istotne ograniczenie w przypadku “pro forma” wystawianych z dużym wyprzedzeniem - wystawienie faktury poza tym oknem może rodzić problemy z prawidłowym określeniem momentu obowiązku podatkowego.
Kiedy faktury zaliczkowej można nie wystawiać
Od 1 września 2023 r. obowiązuje uproszczenie: sprzedawca nie ma obowiązku wystawienia faktury zaliczkowej, jeżeli otrzymał całość lub część zapłaty w tym samym miesiącu, w którym dokonał czynności (art. 106b ust. 1a ustawy o VAT). Uproszczenie to nie działa w przypadkach, dla których terminy wystawienia faktury są określone w art. 106i ust. 3-8 (art. 106b ust. 1b ustawy o VAT).
W tym modelu faktura dokumentująca dostawę lub usługę powinna zawierać datę otrzymania zapłaty - jeżeli taka data jest określona i różni się od daty wystawienia faktury (art. 106e ust. 1a ustawy o VAT). W praktyce wymóg ten nabiera szczególnego znaczenia przy stosowaniu art. 106b ust. 1a, bo nabywca potrzebuje informacji o tym, kiedy faktycznie nastąpiła wpłata.

Wyrok T-689/24 z 11 lutego 2026 r. - argument interpretacyjny, nie zmiana przepisu
Sąd UE w wyroku z 11 lutego 2026 r. (T-689/24) wyraźnie rozróżnił dwie warstwy:
- powstanie prawa do odliczenia - zdarzenie materialne związane z transakcją (dostawa lub wykonanie usługi),
- możliwość jego realizacji - warunek formalny, w tym posiadanie faktury.
Orzeczenie wskazuje, że jeśli podatnik dysponuje fakturą w dniu składania deklaracji za okres, w którym materialnie powstało prawo do odliczenia, uzależnianie tego odliczenia wyłącznie od formalnego 'otrzymania faktury' w kolejnym miesiącu narusza zasadę neutralności VAT i proporcjonalności wynikającą z Dyrektywy 2006/112/WE.
Należy jednak odnotować, że wyrok jest objęty postępowaniem rewizyjnym przed Trybunałem Sprawiedliwości UE (C-167/26 RX) - do czasu jego rozstrzygnięcia wyrok T-689/24 pozostaje w mocy, ale praktyczne zastosowanie jego tez powinno uwzględniać to ryzyko
Co to oznacza praktycznie? Wyrok wzmacnia argumentację za wcześniejszym odliczeniem, ale nie zmienia literalnego brzmienia art. 86 ust. 10b pkt 1, który w polskim systemie nadal wskazuje warunek “nie wcześniej niż w okresie otrzymania faktury”. Należy traktować go jako narzędzie interpretacyjne i argument w sporach z organami podatkowymi. Decyzja o stosowaniu podejścia wynikającego z wyroku powinna uwzględniać politykę firmy wobec potencjalnych sporów.
W kontekście zaliczek orzeczenie ma szczególne znaczenie dla cash-flow: przy wysokich zaliczkach nawet przesunięcie odliczenia o jeden miesiąc realnie obciąża płynność finansową.
KSeF a faktury zaliczkowe
W środowisku KSeF moment udostępnienia faktury jest jednoznacznie rejestrowany systemowo, co ogranicza spory o to, kiedy nabywca “miał fakturę” - kluczowe dla ustalenia momentu odliczenia. To wzmacnia bezpieczeństwo stosowania podejścia wynikającego z wyroku T-689/24. Faktura z błędną stawką VAT w KSeF - jak skorygować?
Faktura końcowa po zaliczkach powinna wskazywać numery KSeF wcześniejszych faktur zaliczkowych lub - dla faktur nieustrukturyzowanych - ich numery (art. 106f ust. 3 ustawy o VAT), co zapewnia pełną spójność dokumentacyjną całego cyklu transakcyjnego.

Jeśli w Twojej codziennej pracy pojawiają się podobne pytania o rozliczanie faktur zaliczkowych, automatyzację rozliczeń i bezpieczeństwo dokumentów, warto sprawdzić, jak działa Księgoboty. To narzędzie stworzone z myślą o praktykach biur rachunkowych, wspierające automatyzację powtarzalnych czynności i ułatwiające zgodność z przepisami. Możesz przetestować je przez 14 dni bezpłatnie po rejestracji na ksiegoboty.pl.


